Předmětem sběru je nať (Herba absinthii), sbíraná seřezáváním v době květu, asi 5 až 10 cm nad koncem zdřevnatělé lodyhy. Kvalitnější drogou je list s květem (Folium cum flos absinthii), který získáváme sdrhnutím z uřezané lodyhy. Droga má kořenité aroma a hořkou až odpornou chuť.
Asi nejdůležitější obsahovou látkou v pelyňku je silice s chamazulény a s 10% obsahu toxického tujonu. Rostlina dále obsahuje tujol, kandiden, felandren, hořké seskviterpenové laktony, hořký absinthin a anabsinthin, flavonoidy, třísloviny a malá množství dalších látek.
"Pelyněk je utrejch", říkával bylinář Franěc, a nám nezbývá nic jiného, než mu dát za pravdu. Pelyňkové aromatické hořčiny jsou neobyčejně výrazné a mohutně podporují tvorbu žaludečních šťáv a zažívání vůbec. Droga zvyšuje sekreci šťáv po celé délce zažívací trubice, ovlivňuje činnost žlučníku a jater, dezinfikuje a tlumí křeče, takže se výborně uplatňuje při bolestech břicha nejrůznějšího původu. V gynekologii výborně utlumí premenstruační tenzi a bolesti, které někdy menstruaci provázejí.
Běžnou lékovou formou je nálev. V každém případě se musíme vystříhat podávání nadměrných dávek, obyčejně postačí dávat dětem 1 a dospělým 2 až 3 polévkové lžíce. U pelyňku se některé účinné látky velice obtížně vyluhovávají ve vodě, proto je podívání tinktury mnohem vhodnější. Tinkturu dávkujeme od 20 do 50 kapek, podle potřeby i vícekrát denně. Velmi účinnou lékovou formou je také pelyňkové víno.
Droga není vhodná pro dlouhodobou léčbu a nedoporučujeme ani její větší dávky. Do směsí se pro svou výraznou účinnost a nepříjemnou chuť přidává pouze v malých objemech, obvykle nepřevyšujících 5 až 10 %. Droga není vhodná pro těhotné a kojící ženy.
Předávkování se projevuje pocitem ošklivosti, nutkáním na dávení, bolestí hlavy a dalšími nepříjemnými příznaky. Při dlouhodobém užívání ve vysokých dávkách (zpravidla ve formě alkoholického nápoje) tedy chronická otrava alkoholickým nápojem zvaným absint je popsána jako "absinthismus" a vedle dalších příznaků je pro ni charakteristická postupná ztráta inteligence. Projevuje se znecitlivěním, třesem, přecitlivělostí, bolestmi v končetinách, křečovými záškuby svalstva, ztrátou vůle, nespavostí, poruchami paměti, poruchami myšlení a děsivými halucinacemi. Akutní otrava velkou dávkou pelyňku se projevuje bolestmi hlavy, třesem, celkovou slabostí, nutkáním na moč a pálením při močení, otrava může končit až bezvědomím. U těhotných může vyvolat potrat. K léčení stačí vynechat další užívání pelyňku.
Také ostatní druhy pelyňků rostoucích u nás se někdy užívají k léčení v obdobných indikacích. Jejich jedovatost je podobná, ve všech případech však slabší.
Jako příklad můžeme uvést léčbu bolestivé menstruace, a to pelyňkovým vínem nebo odvarem z bílého vína. S léčbou musíme začít 2 až 3 dny před menstruací a podáváme 2 polévkové lžíce 4krát denně až do skončení potíží, které obvykle trvají první dva dny menstruace.